Agora que a tão planejada fuga da penitenciária ocorreu, começa a caçada aos fugitivos Lincoln Burrows (Dominic Purcell) e Michael Scofield (Wentworth Miller). Fichtner será o agente federal incumbido da missão.
As filmagens ocorrerão em Dallas - locação que, segundo os produtores, pode se transformar e se fazer passar por várias partes do país. A segunda temporada começa, nos EUA, no dia 21 de agosto.